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2022年的十大创新技术获奖产品中,一部分产品以临床应用为重点,另一部分产品则聚焦在测序和单细胞分析等领域的重大进步。

随着新冠肺炎疫情的急性期逐渐减弱并慢慢退出全球视野,我们可以认为生命科学研究在其中起到了至关重要的作用。在前几年的The Scientist年度十大创新中我们评选了许多新冠研究和治疗相关产品,这些产品在抗击疾病爆发方面起到了很大的贡献,同时,其他一些产品的入选也体现了即使在全球疫情的情况下各个领域也仍然在持续稳定地进步。

从今年的获奖者我们可以看到,随着世界逐渐从SARS-CoV-2给我们带来的最坏情况中复苏,各个研究企业逐渐恢复势头并推出让人振奋的新产品。其中包括可以以100美元的价格对人类基因组进行测序的技术,用于研究单个细胞和亚细胞结构的高灵敏度成像平台,以及促进蛋白质发现的分析系统。还有一些以临床为重点的工具,如用于检测肿瘤切除后残留癌细胞的个性化测序panel,用于便携监督基因和细胞治疗的软件跟踪系统,以及提高技术人员分析母亲血液中胎儿DNA能力的DNA处理工具。

2022年独立评委小组选出了今年的十大创新科技产品,现公布如下。

1. NeXT Personal™ Personalis

肿瘤切除后,少量的癌细胞会留在体内,这种现象被称为微小残留病变(MRD),可能会导致肿瘤复发。Personalis的NeXT Personal™ 检测系统于2021年12月发布,其用于患者自身的肿瘤检测、量化和监测循环肿瘤DNA,以发现MRD并跟踪治疗反应。

不列颠哥伦比亚大学的肿瘤学家Jonathan Loree于8月开始与Personalis合作,使用NeXT Personal对胰腺或结肠肿瘤切除的患者进行研究,测试该技术诊断疾病复发的能力。Loree表示,如果这种检测方法可以取代传统的CT诊断扫描和血液检测,“那么它能够有效节省资金并改善结果。”Norton表示,NeXT Personal目前仅用于研究,计划明年扩展到临床试验阶段。

2. CosMx™ Spatial Molecular Imager NanoString Technologies

CosMx ™ 空间原位分子成像系统(SMI)可以在单细胞甚至亚细胞水平上可视化和量化RNA和蛋白质水平。该平台由NanoString Technologies开发,允许用户按照标准流程制备特定探针和抗体,并将其与样本杂交,这些样本可以是冷冻组织切片或福尔马林固定的石蜡包埋切片。在自动化仪器中,报告基团与样本杂交并成像,然后荧光染料用紫外光裂解并在下一个报告基团与样本杂交之前洗掉,从而使研究人员能够在一个样本中成像多个目标。

3. UG100™ Ultima Genomics

Ultima Genomics于今年5月宣布,他们开发了一项能够以100美元的价格对整个人类基因组进行测序的新技术。到目前为止,只有少数客户有机会使用该公司的新平台UG100™, Ultima Genomics预计将在2023年上半年全面发布该产品。该公司首席商务官Josh Lauer表示,与其他测序仪相比,UG100具有几个优势,包括速度更快、效率更高、浪费更少等。

Lauer将UG100的许多优点归功于一个独特的特点:圆形、开放式流动池。Lauer解释说,将试剂直接放置在旋转的硅片上,相较于通过传统流动池泵送试剂能够更有效地分配试剂。此外,旋转式设计提高了数据采集和成像速度,使Ultima的测序仪能够在大约20小时内完成一次运行,这大约是现有技术的两倍。“就像CD播放机一样,这可以实现对遗传物质的超高速扫描。”

4. Proteograph™ Product Suite Seer

生物技术公司Seer的产品管理总监Rebecca Rutherford表示,蛋白质组学研究传统上面临两个关键挑战:标记蛋白质的需求限制了对已知蛋白质的研究,而蛋白质组的庞大多样性使得研究低丰度蛋白质变得困难。Seer于2022年1月推出的Proteograph™解决了这两个问题,使用基于纳米颗粒的阵列可以对生物流体样品中的所有肽进行无偏采样。“Proteographer的创新实际上是围绕我们专有的工程纳米颗粒进行的,这些纳米颗粒具有独特的表面功能化,可以在整个动态范围内吸引蛋白质。”卢瑟福说,这使得研究人员能够追踪与疾病相关的小分子变化,从而能够鉴定新的和生物相关的蛋白形式。

5. LIVE T Cell Assay Nanolive

在过去十年中,Nanolive开发了重构无标记样本三维全息结构的成像平台。2021年9月,他们推出了第一个针对特定应用的数字检测方案,即LIVE T Cell assay,这项技术旨在检测T细胞如何定位、结合、压迫和杀死其靶细胞,如被感染细胞、外来细胞和癌细胞。它能够测量T细胞和靶细胞的表型和形态参数,但Nanolive的科学传播经理Emma Gibbin Lameira表示:“产品真正新颖的是我们可以从两者之间的相互作用中提取相应的指标。”她补充道,这些信息在测试药物的疗效方面非常有用。例如,您可以评估特定抗体是否使T细胞更接近目标,以及它是否增加了细胞的杀伤率。

6. MARS® Bar Applied Cells, Inc.

分选细胞最有效的方法之一是免疫磁性分离,这项技术基于附着在特定细胞表面抗原上的磁珠进行细胞分选。虽然市场上有几种产品采用这种方法,但Applied Cells,Inc.推出的全新的MARS®Bar系统还具有多项优势,Applied Cells公司应用副总裁Liping Yu表示。例如,MARS Bar是一个全封闭系统,采用无菌流体套件进行分选,这使得它“更容易管理”,因此它的使用不再局限于洁净室或生物安全柜。此外,该设备包含三个模块,允许它并行处理三个样本。

哥伦比亚大学(Columbia University)助理教授谢尔盖·鲁琴科(Sergei Rudchenko)和Applied Cells一直在进行科学合作。自2月份以来,他一直在使用该产品在细胞输注过程中从外周血单核细胞中去除幼稚T细胞。Rudchenko表示,他有兴趣将该方案开发成一种临床应用,以预防移植物抗宿主病。根据他的说法,MARS Bar在去除多余细胞后,血细胞的回收率比其他市面上的类似方案高出约八倍,此外,在纯度方面也相当有竞争力。

RAO:“非常创新地使用了磁分离技术,无需固定磁铁,从而实现高通量分选。”

7.Single Cellome™ System SS2000 Yokogawa Electric Corporation

Yokogawa推出的Single Cellome™ System SS2000是一台亚细胞自动取样系统,它包括了用于观察组织的转盘共聚焦显微镜,以及用于从单个细胞中收集整个细胞或细胞内成分的取样装置。

该系统于2022年2月在日本、美国和中国推出,可以实现完全自动化,使用户能够根据细胞质面积、细胞核大小或其他形态学特征来定义应该对哪些细胞进行采样。将符合特定轮廓的细胞吸出并沉积在96孔板中以进行进一步分析。该系统还可以直接采集细胞内成分,如细胞器或细胞质的一部分,并将这些信息与全细胞采样相结合。Yokogawa全球营销主管Takanobu Kiuchi表示,SS2000的“高分辨率3D图像允许研究人员以高度精确的方式控制细胞和亚细胞采样的位置,并保留空间背景”。

8. LightBench® Detect Yourgene Health

LightBench Detect®是一种DNA处理工具,可用于无创产前检测(NIPT),包括从母亲血液中采集胎儿DNA。Yourgene Health产品经理Becky Underwood解释说,LightBench Detect是根据长度在母体DNA簇中分离胎儿DNA的微小链片段。

安德伍德表示,该产品采用Yourgene的成像系统Ranger Technology对凝胶进行成像,并对电压进行实时调整,以优化DNA链分离。他补充道,LightBench Detect是市场上唯一一款可以使用塑料EDTA采血管的仪器,这种仪器更便宜,更不易破损,并且比工业标准玻璃更高效。根据Yourgene的产品页面,LightBench® Detect使每个样本的胎儿DNA产量增加了50%到75%。除了用于NIPT之外,LightBench Detect还有更广泛的应用,包括扫描血液样本中的肿瘤DNA或传染性病原体。

9. Molecular Cartography™ Resolve Biosciences

Resolve Biosciences的Molecular Cartography™ 是一种单分子荧光原位杂交技术,它能够提供细胞内基因表达的三维视图,而不会损坏组织切片或细胞培养样品。该公司去年推出了该平台作为一项技术服务,该服务在2021十大创新中就已经占据了一席之地。Resolve Biosciences于今年1月开始逐步在客户实验室安装全自动Molecular Cartography工作流程的硬件和软件。

该公司联合创始人兼首席执行官Jason T.Gammack表示:“我们能够将检测带入实际的疾病状态,并绘制组织内单分子水平的相互作用”。Gammack说,该平台能够获得亚细胞基因表达的高分辨率图像,除了提供对细胞转录景观的独特见解外,这些图像“相当惊人”。“你现在可以看到生物学的美丽图景。”KAMDAR:“这种亚细胞基因表达活性的景观图像可以促进对关键生物学机制的相互作用和复杂性的新见解。”

10. OCELLOS 3.0 TrakCel

细胞和基因治疗已经开始彻底改变生物医学,但在追踪所涉及的材料,包括患者自身的细胞方面等也提出了新的挑战。为了应对这些挑战,TrakCel于2021 2月推出了一款名为OCELLOS的基于云的软件,并于今年7月发布了一个新的迭代版本OCELLOS3.0。“这是一个非常简单的计算机界面,在整个供应链中都很容易访问,”TrakCel的联合创始人、公司科学事务和产品开发副总裁Matthew Lakelin说道。莱克林指出,OCELLOS 3.0不仅提高了此类治疗的安全性和质量,还管理了监管机构要求的身份链和监管链数据。

VAN VLIET:“该产品可以帮助集中、简化和减少细胞/基因治疗(CGT)开发和生产中复杂供应链和任务物流中的错误。”

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