本
文
摘
要
步骤:组织RNA提取(Trizol法)——RNA浓度测定及反转录——跑PCR——数据处理△△CT
1组织RNA提取(Trizol法)
每50mg组织,1ml Trizol,匀浆,最大转速瞬离匀浆管。将溶液吸入到新的EP管中,室温放置5min。加入0.2ml(1/5Trizol)氯仿,剧烈混匀,溶液呈现乳状,室温静置5min,4℃ 12000g离心15min。 吸取上层水相于新的EP管中(注意不要吸到中间层,一般1ml Trizol可以吸到400-500ul液体)。加入1.5倍体积的异丙醇(600ul),上下颠倒混匀,室温静置10min,4℃ 12000g离心10min。弃上清,注意不要弃去RNA白色沉淀,加入1ml 75%乙醇(用DEPC水配)洗涤三次,室温晾干5-10min。加入30ul DEPC水溶解RNA。
Trizol为苯酚+Rnase抑制剂,酸性。
2RNA浓度测定及反转录
NanoDrop测浓度,放置于-80℃冰箱保存或直接进行反转录。
反转录体系:1000ng RNA,4ul 5× RT Master mix,RNase free water补足到20ul
混匀后放入PCR仪反应,条件如下:37℃, 30min → 85℃, 1min → 4℃, ∞
ddH2O将反转录后的cDNA稀释到2.5 ng/ul,-80℃保存。
3Qpcr(48孔板)
内参:Gapdh,引物设计通过NCBI数据库(Gene-家鼠…)
体系:5ulSYBR,0.4ul前后引物,2ulcDNA ,RNase free water补足到10ul
封膜离心跑PCR
数据处理:△△CT法,比较看情况使用t检验或方差分析。Rnase抑制剂,酸性。
2RNA浓度测定及反转录
NanoDrop测浓度,放置于-80℃冰箱保存或直接进行反转录。
反转录体系:1000ng RNA,4ul 5× RT Master mix,RNase free water补足到20ul
混匀后放入PCR仪反应,条件如下:37℃, 30min → 85℃, 1min → 4℃, ∞
ddH2O将反转录后的cDNA稀释到2.5 ng/ul,-80℃保存。
3Qpcr(48孔板)
内参:Gapdh,引物设计通过NCBI数据库(Gene-家鼠…)
体系:5ulSYBR,0.4ul前后引物,2ulcDNA ,RNase free water补足到10ul
封膜离心跑PCR
数据处理:△△CT法,比较看情况使用t检验或方差分析。